TCGA数据库的基因生存分析是怎样的，针对这个问题，这篇文章详细介绍了相对应的分析和解答，希望可以帮助更多想解决这个问题的小伙伴找到更简单易行的方法。
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最近看到文献里面提到了针对膀胱癌的METTL3基因的生存分析，我定睛细看，发现并不是TCGA里面的表达数据，而是IHC的结果，如下：
f. Kaplan-Meier survival curves of overall survival in 180 bladder cancer patients based on METTL3 expression analyzed by IHC staining. The log-rank test was used to compare differences between two groups (P = 0.0128)
image-20200414003447516 结果是相当的显著哦，所以我就思考，为什么作者要舍近求远呢，明明是tcga数据库里面大把的公共数据，很容易检验自己感兴趣的基因是否具有生存效应。
所以我就帮助作者在网址：http://gepia2.cancer-pku.cn/#survival 看了看膀胱癌的METTL3基因的生存分析，同样的UCSC的xena浏览器也是可以做到，感兴趣的可以去学习：GEPIA2详解（中国智造-肿瘤数据库），当然了，也可以自行编程探索。
如下，有意思的就来了：
image-20200414003502774 其实更有意思的是，你还可以使用km-plot网页工具来看膀胱癌的METTL3基因的生存分析，虽然我是不相信km-plot网页工具结果的。
我们已经多次介绍过生存分析:
apply家族函数和for循环还是有区别的（批量生存分析出图bug） 是不是
可以合理的推测 ，因为作者发现自己感兴趣的基因，也就是METTL3在TCGA数据库的膀胱癌里面并没有统计学显著的生存意义，所以就想方设法的去购买TMA，看看IHC结果的针对膀胱癌的METTL3基因的生存分析。 关于TCGA数据库的基因生存分析是怎样的问题的解答就分享到这里了，希望以上内容可以对大家有一定的帮助，如果你还有很多疑惑没有解开，可以关注创新互联行业资讯频道了解更多相关知识。
分享名称：TCGA数据库的基因生存分析是怎样的
URL分享：
http://www.cdkjz.cn/article/psgpgo.html
