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这篇文章主要介绍了EVLncRNAs数据库有什么用,具有一定借鉴价值,感兴趣的朋友可以参考下,希望大家阅读完这篇文章之后大有收获,下面让小编带着大家一起了解一下。
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在已有的lncRNA数据库中,包含了两种类型的lncRNA, 一种是实验手段证实过的lncRNA, 另外一种是软件预测出来的lncRNA,其中软件预测的结果是存在很多的假阳性的。
EVlncRNAs是目前最大的实验验证的lncRNA数据库,收录了来自动物,植物,微生物共77个物种,1543个lncRNA, 除了染色体位置,外显子个数,长度等基本信息外,还提供了lncRNA相关的疾病,lncRNA功能注释,lncRNA与其他分子的相互作用等信息,数据库网址如下
http://biophy.dzu.edu.cn/EVLncRNAs/
以H19
这个lncRNA为例,包含了以下几种信息
包括lncRNA id, name, 染色体定位,外显子个数,转录本编号等基本信息,示意如下
通过整合了lncRNADisease, lnc2Cancer等数据库以及已经发表的文献,提供了lncRNA相关的疾病信息,示意如下
包括了lncRNA与miRNA, protein, TF等相互作用信息,示意如下
该数据库中的信息是免费下载的,示意如下
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