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怎么用R语言ggplot2画气泡图来展示基因表达量,相信很多没有经验的人对此束手无策,为此本文总结了问题出现的原因和解决方法,通过这篇文章希望你能解决这个问题。
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今天重复的内容是论文中的figure2f
今天的推文主要介绍其中的气泡图,明天的推文介绍如何向气泡图上叠加树形图
按照论文提供的代码得到了画图用到的数据,部分数据如下
但是用他提供的画图代码没有能够画出图来。因为他用到了一个dot_plot()
函数,没有找到这个函数是怎么来的。既然已经拿到了数据,就用ggplot2自己来画吧
data.final<-read.csv("NM/figure2f.csv",header=T)
head(data.final)
ggplot(data.final,aes(x=features.plot,y=id))+
geom_point()
ggplot(data.final,aes(x=features.plot,y=id))+
geom_point(aes(size=`Percent expressed`,
color=`Average expression`))
包括
ggplot(data.final,aes(x=features.plot,y=id))+
geom_point(aes(size=`Percent expressed`,
color=`Average expression`))+
theme_bw()+
theme(panel.grid = element_blank(),
axis.text.x=element_text(angle=90,hjust = 1,vjust=0.5))+
scale_color_gradient(low="lightgrey",high="blue")+
labs(x=NULL,y=NULL)
看完上述内容,你们掌握怎么用R语言ggplot2画气泡图来展示基因表达量的方法了吗?如果还想学到更多技能或想了解更多相关内容,欢迎关注创新互联行业资讯频道,感谢各位的阅读!
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