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这篇文章给大家分享的是有关BioGRID数据库有什么用的内容。小编觉得挺实用的,因此分享给大家做个参考,一起跟随小编过来看看吧。
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BioGRID数据库是一个老牌经典的蛋白质相互作用数据库,在今年9月份刚刚分布了最新版本3.5.165,该版本从66,164篇文献中整理出了1,607,037个蛋白质相互作用,28,093个嵌合体信息以及726,378个转录后修饰PTM信息,涵盖了多个物种,官网地址如下
https://thebiogrid.org/
通过官网的检索功能,可以根据基因或者蛋白标识符进行检索,示意如下
在检索页面主要分成以下3大部分
示意结果如下,包含了蛋白质的名称,别名,转录后修饰,即UBI
对应的行,GO注释信息,和其他数据库的链接
示意如下,统计每种相互作用类型的数目和比例
示意如下,可以查看Interactors
等详细信息
通过Network
菜单,可以显示该蛋白质的相互作用网络,示意如下
BioGRID数据库中的数据是免费开放下载的,下载链接如下
https://downloads.thebiogrid.org/BioGRID
和其他数据库类似,同时提供了TAB
和XML
格式供下载。
感谢各位的阅读!关于“BioGRID数据库有什么用”这篇文章就分享到这里了,希望以上内容可以对大家有一定的帮助,让大家可以学到更多知识,如果觉得文章不错,可以把它分享出去让更多的人看到吧!
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