linux查找基因命令 linux 查找语句

怎么在linux中查找文件中的所有基因

1. find 路径 -name 文件名 2. updatedb locate 文件名 如果没有updatedb或locate命令，需要安装mlocate

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求LINUX系统中，查找命令和标准输出命令的使用，如find 、print. ？

命令whereis 查找可执行文件，源代码，帮助文件的绝对路径。

命令which告诉我们当输入某个命令执行时，SHELL到底调用了哪个版本的命令。

然后是最重要的find命令，譬如我们要在/usr目录查找文件intelism：

find /usr -name intelism -print

具体的参数可查看man文档。

然后是查找文件中的字符串，命令是grep,egrep,fgrep.一般我们都用grep,但egrep支持全部的正则表达式。比如我们要查看./intelism文件里的字符"xingshangdeluren"

grep -n "xingshangdeluren" ./intelism

比如要查看所有以A或者a开头的字符串那么：

grep -n -i '\a' ./intelism

比如我们要看~/intel/文件下有没有SIZE为0的文件:

ls -l ~/intel/ | grep “0”| cut -f10 -d' '

我也刚学，不是太懂，你可以自己去查MAN文档和上论坛和实践

使用grep命令提取指定基因信息

准备基因名称信息

编写脚本

没有得到结果文件，使用cat -v 命令查看文件格式，发现结尾有^M的标记

dos2unix是将Windows格式文件转换为Unix、Linux格式的实用命令。Windows格式文件的换行符为\r\n ,而UnixLinux文件的换行符为\n. dos2unix命令其实就是将文件中的\r\n 转换为\n。

而unix2dos则是和dos2unix互为孪生的一个命令，它是将LinuxUnix格式文件转换为Windows格式文件的命令。

感谢梁同学提供的帮助

再次运行脚本，得到相关基因信息

发现没有表头，先把第一行提取出来就可以

再运行脚本，得到结果信息：